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小麦外显子捕获测序

外显子组测序(Exome Sequencing)是指利用靶向捕获技术将全基因组外显子区域捕获并寓集后进行离通里测序的基因组分析方法。

接对基因功能相关的编码序列逬行研究,大大减少了测序费用,拒比于全基因组m测序,外显子组测序更加经济、高效、深入。

简化外显子组测序(cSNP-Sequencing)相对于基因芯片,能够提供更为完整的变异信息以及变异位点附近的序列信息,超高密度的标记数置,11万HC基因蒗盖,大于600KCSNP、

I nDel、CNV等变异检测。

小麦全外显子测序,全新260M/300M目标捕获区间设计,覆盖超过15万/16万个基因。

设计

1、 基于IWGSC参考基因组及基因注释设计;基于AKS8基因组及注释设计;

2、 增加3000+份小麦转录组数据注释,包含所有组织及发甯时期;

3、 埵加20+份Pacbio三代全长转录本测序数据进行基因组注释;

4、 塯加100+份LncRNA深度测序数据进行长链非编码基因注释;


捕获

目标区域> 260M/300M            捕获基因数> 1S万/16万

优化

1、 深度基因区域驪盖,确保突变位点的萁实性;

2、 超冗余探针设计.保证目标区域有效捕获;

3、 多重探针密度校正,保i正捕获均一性;

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